作业帮哪位专家用简单通俗的语言给我讲讲SSR标记以及和RAPD的差别
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/05/03 05:15:48
哪位专家用简单通俗的语言给我讲讲SSR标记以及和RAPD的差别
哪位专家用简单通俗的语言给我讲讲SSR标记
以及和RAPD的差别
哪位专家用简单通俗的语言给我讲讲SSR标记以及和RAPD的差别
微卫星DNA又叫简单重复序列,指的是基因组中由1～6个核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA,广泛分布于基因组的不同位置,长度一般在200bp以下.研究表明,微卫星在真核生物的基因组中的含量非常丰富,而且常常是随机分布于核DNA中.
微卫星中重复单位的数目存在高度变异,这些变异表现为微卫星数目的整倍性变异或重复单位序列中的序列有可能不完全相同,因而造成多个位点的多态性.如果能够将这些变异揭示出来,就能发现不同的SSR在不同的种甚至不同个体间的多态性,基于这一想法,人们发展起了SSR标记.
SSR标记又称为sequence tagged microsatellite site,简写为STMS,是目前最常用的微卫星标记之一.由于基因组中某一特定的微卫星的侧翼序列通常都是保守性较强的单一序列,因而可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序,然后根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增,从而将单个微卫星位点扩增出来.由于单个微卫星位点重复单元在数量上的变异,个体的扩增产物在长度上的变化就产生长度的多态性,这一多态性称为简单序列重复长度多态性(SSLP),每一扩增位点就代表了这一位点的一对等位基因.由于SSR重复数目变化很大,所以SSR标记能揭示比RFLP高得多的多态性,这就是SSR标记的原理.
RAPD 技术是建立在PCR (Polymerase Chain Reaction)基础之上的一种可对整个未知序列的基因组进行多态性分析的分子技术.
其以基因组DNA为模板,以单个人工合成的随机多态核苷酸序列( 通常为10 个碱基对) 为引物,在热稳定的DNA 聚合酶( Taq 酶) 作用下,进行PCR 扩增.扩增产物经琼脂糖或聚丙烯酰胺电泳分离、溴化乙锭染色后,在紫外透视仪上检测多态性.扩增产物的多态性反映了基因组的多态性.
其实都是基于序列的多态性分析分子技术,只不过针对对象和最终目的不同.
我的毕业论文就是开发SSR标记的
SSR:就是简单重复序列, 如GGGGGGG,CCCCCCCC(单核苷酸的重复),GTGTGTGTGTGT(二核苷酸重复)....等等,重复次数不定. 这个的前提是要知道该生物的序列.
RAPD,未知序列的基因组