如何在NCBI上寻找要扩增的序列?我要用PRIMER 设计引物.位点是CYP2C19*2,是一个SNP的位点.我在NCBI里查到了这个基因的信息.现在我有3个问题如下：1.引物设计的对象是FASTA中的序列还是GENEBANK中的

来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/04/28 01:00:09
如何在NCBI上寻找要扩增的序列?我要用PRIMER 设计引物.位点是CYP2C19*2,是一个SNP的位点.我在NCBI里查到了这个基因的信息.现在我有3个问题如下：1.引物设计的对象是FASTA中的序列还是GENEBANK中的

如何在NCBI上寻找要扩增的序列?我要用PRIMER 设计引物.位点是CYP2C19*2,是一个SNP的位点.我在NCBI里查到了这个基因的信息.现在我有3个问题如下：1.引物设计的对象是FASTA中的序列还是GENEBANK中的
如何在NCBI上寻找要扩增的序列?
我要用PRIMER 设计引物.位点是CYP2C19*2,是一个SNP的位点.我在NCBI里查到了这个基因的信息.现在我有3个问题如下：1.引物设计的对象是FASTA中的序列还是GENEBANK中的序列?据说这两个一个是模板链,一个是非模板链.2.该SNP是G 683 A...请问683是怎么数的?3.设计引物的时候是从SNP上下选取多少bp的碱基合适?100?还是500?

如何在NCBI上寻找要扩增的序列?我要用PRIMER 设计引物.位点是CYP2C19*2,是一个SNP的位点.我在NCBI里查到了这个基因的信息.现在我有3个问题如下：1.引物设计的对象是FASTA中的序列还是GENEBANK中的
博凌科为-为你回答之前,提醒你注意一个问题,那就是先要搞清楚gene的大致概念.一般而言,一个完整gene是有起始密码子和终止密码信息的,还有各种已知的其他预示结构,所以1.不管哪个序列,你能找到起始密码子及终止密码子,就是这条序列了.2.从这个gene的起始位置算喽3.选取的位置,没有绝对规矩.一方面取决上下游位置的保守情况,越保守越好,还取决pcr和测序情况,你擅长测2,300bp的序列呢,还是500以上的bp呢?回答完毕,得奖励楼!

Q1: FASTA 和Genbank是格式的不同，序列是完全一致的。无论哪一个都是非模板链。
Q2: 不知道你的683是从哪里查到的，似乎应该是681。给你一个网址参考一下。 http://www.cypalleles.ki.se/cyp2c19.htm
根据作者收集的蛋白质序列变化信息，记数位点1是转录(CDS序列)ATG的A, 注意一般没有0位点，5‘端从-1开始编码
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Q1: FASTA 和Genbank是格式的不同，序列是完全一致的。无论哪一个都是非模板链。
Q2: 不知道你的683是从哪里查到的，似乎应该是681。给你一个网址参考一下。 http://www.cypalleles.ki.se/cyp2c19.htm
根据作者收集的蛋白质序列变化信息，记数位点1是转录(CDS序列)ATG的A, 注意一般没有0位点，5‘端从-1开始编码
Q3:不知道你是从基因组测还是cDNA测？如果从cDNA测，你可以参考文献中的引物 http://www.jbc.org/content/269/22/15419.full.pdf

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如何在NCBI上寻找要扩增的序列?我要用PRIMER 设计引物.位点是CYP2C19*2,是一个SNP的位点.我在NCBI里查到了这个基因的信息.现在我有3个问题如下：1.引物设计的对象是FASTA中的序列还是GENEBANK中的 如何在NCBI上得到猪的CDS序列我要进行猪密码子的偏好性分析,可还不知道怎么得到猪的CDS序列, 如何在ncbi上查找3‘UTR的序列 如何在NCBI上查找自己需要的基因序列 如何在NCBI上查找某个基因的序列?如何在NCBI上查找FRAT1的基因序列? 如何在NCBI里得到序列老板要我找一个AK065863的序列设计引物 但是我在ncbi的geobank上拿AK065863搜出来的是 nc008404 和老板给的名字不一样⊙﹏⊙b 不知道到底该怎么查 还有那个如何下载序列也请 如何在NCBI上注册一个基因我扩增到了一个基因的全长,并且可以确定是没人注册过的,请问如何在NCBI上注册它呢? 如何在NCBI中搜索乙肝病毒八种亚型的全基因组序列我要的结果是只出现那八个结果.如何实现啊,纠结ING 如何在NCBI查找ALVgp37基因的碱基序列 如何在NCBI上查基因序列 看到马上给分 比如查乙肝抗体的基因序列 如何在人类基因组中查找只有10bp的序列核苷酸序列为10bp,要知道其在基因组中的位置,最后能再知道其周围的基因情况前几天我已经用NCBI上的BLAST找过，每次都是No significant similarity found,可能 如何在ncbi上查玉米叶绿体的同源重组片段的基因序列,如TrnA、TrnL、 TrnI?我在search里面通过gene选项搜索时显示的条目很多是tRNA序列,都是转运RNA的序列,很短,而我要找的是很大的同源片段,希望 请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗?如题,在blast的时候是否要保留当时做dna扩增时的pcr引物序列.……以前做的一个系列是通过提取重组质粒测序,不去引物的,但是现在做的内 如何在NCBI上查到某个给定基因的序列,并且在序列中清楚的显示出其中的外显子和内含子? 我提取RNA,反转录得到cDNA,我要由此扩增功能基因,请问引物设计时,用查到的mRNA序列,还是用cDNA序列我要克隆一个基因,从NCBI查到该基因近似物种的mRNA(没有查到cDNA).我的路线是先提取RNA,反转录 如何在NCBI查找一个已知植物基因的启动子序列, BT蛋白的基因名是什么啊?我要在NCBI上查他的基因序列~ 如何在NCBI里找一段氨基酸序列?